Μετά την παρακολούθηση των μαθημάτων της παρούσας μεταπτυχιακής ειδίκευσης οι μεταπτυχιακοί φοιτητές αναμένεται :
- να είναι ενημερωμένοι για την τρέχουσα εξέλιξη και το εύρος εφαρμογών της Υπολογιστικής Χημείας και της Μοριακής Σχεδίασης και Μοντελοποίησης,
- να κατέχουν σε ικανοποιητικό βαθμό το θεωρητικό υπόβαθρο της Υπολογιστικής Χημείας και συγκεκριμένα τη Κβαντική Θεωρία, την Θεωρία Hartree-Fock και την Ηλεκτρονική Συσχέτιση, τη Θεωρία του Συναρτησιακού Παράγοντα Πυκνότητας και τη Μοριακή Μηχανική και Δυναμική,
- να κατέχουν σε ικανοποιητικό βαθμό τη θεωρία και την πρακτική των μεθόδων μεταβολών και διαταραχών,
- να έχουν ευχέρεια χρήσης υπολογιστικών πακέτων Υπολογιστικής Χημείας και Μοριακής Μοντελοποίησης όπως Gaussian03, GAMESS, ADF, NWChem, Spartan, HyperChem, Avogadro
- να έχουν τη δυνατότητα ερμηνείας των αριθμητικών αποτελεσμάτων, πρόβλεψης με βάση αυτά της πειραματικής συμπεριφοράς των μοριακών συστημάτων και συσχέτισης αριθμητικών αποτελεσμάτων με πειραματικά ευρήματα.
- να έχουν την ικανότητα επιλογής της κατάλληλης μεθόδου και λογισμικού για τη μελέτη κάθε στατικής ή δυναμικής ιδιότητας που σχετίζεται με τη μοριακή δομή και τη δραστικότητά της.
Μετά την εκπόνηση της Διπλωματικής Εργασίας τους οι μεταπτυχιακοί φοιτητές αναμένεται να έχουν κατακτήσει σε μεγάλο βαθμό την μεθοδολογία έρευνας στην Υπολογιστική Χημεία και τη Μοριακή Σχεδίαση και Μοντελοποίηση.
Τέλος, μετά την ολοκλήρωση του παρόντος μεταπτυχιακού τίτλου οι μεταπτυχιακοί φοιτητές θα έχουν αποκτήσει μια βαθιά κατανόηση των ιδιοτήτων μοριακών συστημάτων και υλικών και θα έχουν όλα τα προσόντα σε θεωρητικό και πρακτικό επίπεδο για τη συνέχιση των σπουδών τους με την εκπόνηση Διδακτορικής Διατριβής με αντικείμενο την Υπολογιστική Χημεία και τη Μοριακή Σχεδίαση και Μοντελοποίηση.